Nat Biotechnol：研究不能重复？可能是HeLa细胞系“逆”了

HeLa胺基酸已经在世界各地的许多实验室培育了近70年，并且多年来被确信是无限供应的不反为的不同胺基酸。然而，2月初18日发表在《Nature Biotechnology》杂志上的一项新深入研究表明，胺基酸在不同实验室两者之间依赖于很大差异适度，这引发了对胺基酸系深入研究重复使用适度的质疑。“我很高兴看到这项深入研究，但在某种意义上我并不感到惊讶，”亨特巴尼琳癌症里面心的底物微生物学家Prasad Jallepalli真是，他很难参与这项深入研究。这并不是HeLa胺基酸系自孕育以来第一次出现丰富多彩的报道：多年来，其他深入研究团队也不可否认HeLa胺基酸个体差异适度锥体两者之间在胺基酸序列和RNA表达出来的显着差异适度。这项最新深入研究首次全面分析了各种HeLa个体差异适度锥体的遗传个体差异适度（不同批次的HeLa胺基酸系生活在世界各地的各个实验室），并且首次证明遗传遗传基因导致了胺基酸表达出来和遗传基因的巨大反为化。HeLa胺基酸“反为了”？在这项深入研究里面，深入研究人员从6个各地区的13个实验室得来了14份HeLa样本，并在不同的实验室条件下进行培育。他们首先量化了胺基酸拷贝数个体差异适度，揭示了它们胺基酸组两者之间的显着差异适度。结果发现，HeLa个体差异适度锥体两者之间，特别是CCL2和Kyoto个体差异适度锥体两者之间依赖于着巨大的遗传基因。进一步的分析表明，许多这些遗传差异适度转化为mRNA产生的巨大反为化，并且在相当大程度上转化为胺基酸丰度的巨大反为化。深入研究人员调查报告真是，HeLa CCL2和Kyoto胺基酸系的特异适度组和胺基酸组谱彼此两者之间的差异适度，就像来自两种不同类型组织起来的癌胺基酸系两者之间的差异适度一样。HeLa个体差异适度锥体在培育每一次里面湿润反应速度也不同，一些胺基酸群需17.5小时才能翻倍，而另一些胺基酸在不同的培育条件下需话费多达32小时。它们对沙门氏菌病菌的反应也各有不同：与其他两种反为锥体相比，一种反为锥体对病菌的敏感适度较低，深入研究人员将其或许低水平的胺基酸亚基，这种胺基酸亚基在寄生虫进入宿主胺基酸里面起作用。在一项单独的实验里面，深入研究团队通过培育胺基酸系三个月初，来判读HeLa个体差异适度锥体的胺基酸表达出来是否是时会随着时间发生巨大反为化。深入研究人员记录了早期胺基酸和晚期胺基酸两者之间胺基酸表达出来差异适度左右6%。苏黎世联邦政府分校底物系统生物学深入研究员的Ruedi Aebersell系主任是该深入研究的合着者，他真是，“即使在同一个实验室里，这些胺基酸的差异适度和巨大反为化反应速度也是非常惊人的。”他估计，如果一个深入研究生在项目开始时用HeLa胺基酸系花钱了一个实验，并在六个月初后被承诺重复使用这个实验，他们可能时会受益不同的结果。关于深入研究里面的“可克隆适度危机”的讨论大多数临近在分析方法、数据处理层面的缺陷，以及作为主要涡轮机因素的受污染或贴捏首页的胺基酸系。但是Aebersell确信，HeLa胺基酸系和癌胺基酸系的生物学差异适度可能是这两项。为什么时会“反为”？普林斯顿大学的胺基酸微生物学家Tim Stearns确信有几个可能的诱因可以解释为什么胺基酸系在较长时间培育下时会发生巨大反为化。首先，HeLa胺基酸是已知胺基酸组不稳定的癌胺基酸，因此很可能随时间随机突反为。此外，它们还时会在实验室里面受到各种湿润条件的不良影响，这可能时会促使胺基酸进化出截然不同的相似性。例如，他真是，哺乳动物胺基酸的培育包括将其培育到充满一个黏附为止，从黏附里面抽取一部分胺基酸，然后将它们放在另一个黏附里面湿润，这一每一次称之为分裂。“每个人花钱这件事的方式则都有点不同，”他真是道。最新这些发现，对于本能培育胺基酸的深入研究结果的解释和重现适度有一定的意义。Aebersell和他的同事在学术著作里面提出异议了几个具锥体的解决方案。首先，深入研究人员应该运用于癌胺基酸系的早期传代，并尽可能在同一胺基酸系的不同样本里面重复使用同一胺基酸系的实验。更重要的是，微生物学家应该清楚地调查报告他们在给定的深入研究里面运用于的胺基酸系个体差异适度锥体。